Vormel 1-s on Honda naasnud BAR-i garaazhi, sõitjatena Jacques Villeneuve ja Ricardo Zonta.
2002-2005
2002. aastal esitleti Jaapanis Jazzi, mis osutus hiljem ülipopulaarseks. Sellest Aasta autoks valitud Honda mudelist sai 250 000 müüdud autoga Jaapani turu müüduim automudel kõikide tootjate lõikes.
Samal aastal esitleti ka CR-V teist põlvkonda, millest sai müüduim SUV Põhjamaades. Meediast ja klientidelt saadi positiivset vastukaja heade sõiduomaduste, ruumikuse ja mugavuse eest.


Aasta oli läbimurdeks ka tulevikuautole FCX. FCX oli maailma esimene kütuseelemente kasutav auto, mis sertifitseeriti nn nullsaastega sõidukiks. Lisaks nullsaastele oli FCX selleks igati sobiv ka oma muude näitajate poolest: tankimiste vaheline maksimaalne läbisõit 355 km, suurim võimsus 82 Hj, maksimaalne kiirus 150 km/h ning 4 istekohta.



Uueks suunas Honda toodetearengus oli väike reaktiivlennuk HondaJet. Intensiivne arendustöö, mis päädis esmalennuga detsembris 2003 Põhja-Carolinas USAs, algas juba 80-ndate keskel. Üks HondaJetti selgelt teistest samalaadsetest õhusõidukitest eristav asi oli mootorite asetamine tiibade ülapoolele. Selle ja teiste lahenduste tõttu oli lennuki maksimaalkiirus suurem ja kütusekulu väiksem kui teistel.
2005. esitleti ka täiesti uut mudelit FR-V. Kasutatud 3+3 istmete kontseptsioon oli suhteliselt unikaalne ning tõi koos FR-V elegantse välimuse ja kvaliteetse viimistlusega MPVde klassi uusi ja värskeid tuuli.



Jaapanis valiti uus Honda Legend 2004./2005. Aasta autoks. Kontserni lipulaeval oli mitmeid innovaatilisi uuendusi, nagu näiteks SH-AWD ja Intelligent Night Vision.



2005.aasta oli oluline ka mootorrataste tootmise koha pealt. Masstootmist oli Honda alustanud 58 aastat tagasi ning nende aastate jooksul valmistatud mootorrataste koguarv jõudis tähelepanuväärse 150 miljoni ühikuni!
2006-2008
Septembris 2006 toodi turule kolmanda põlvkonna CR-V Euroopa versioon ja uus Civic TypeR. Oma maailmadebüüdi teeb täiustatud kütuseelemendiga FCX Clarity.


Honda edu võti 2006. aastal oli suur nõudlus uue Civicu järele. Ühendkuningriigis ehitatava Civicu 5-ukseline mudel, mis läks kogu Euroopas müüki aasta alguses, saavutas tänu oma sportlikule disainile ja üldistele omadustele väga suure müügiedu.
2007
2007. aasta veebruaris toimunud Genfi autonäitusel tutvustas Honda uut põnevat ideeversiooni Honda väikesest hübriidsportautost, näitas Euroopas esmakordselt täiesti sõiduvõimelist FCX kütuseelemendiga ideeautot ning tutvustas uue põlvkonna diiselmootorit.
Turule tuuakse maailma esimene mootorratta turvapadjasüsteem, mis on saadaval uuel Gold Wingil.
2008
Jaapanis alustati märtsis 2008 DN-01 suurte sportmootorrataste müüki. Ainulaadses, madalas keres on vedelikjahutusega neljataktiline 680 cm3 OHC V topeltmootor. Juunis 2008 teatas Honda maailma esimesest elektrooniliselt juhitavast kombineeritud ABS-ist, mis on mõeldud Super Sport mootorratastele ning mille eesmärgiks on ühendada ABS ja CBS ühte süsteemi, mis kasutab mõlema süsteemi põhieeliseid ning keskendub eriti Super Sport konteksti nõuetele.
Jaapanis veereb tootmisliinilt maha vesinikküttel Honda FCX Clarity ning USA-s algab nende heitevabade sõidukite müük.
Pariisis autonäitusel esitletakse ideeauto Insight ideeauto, mis näitab Honda viimaseid täiendusi bensiini-elektriauto hübriidi seerias ning samuti astub esmakordselt avalikkuse ette ka uus Jazz.
30. oktoobril 2008 teatas Honda Motor Co., Ltd., et Honda mootorrataste ülemaailmne kogutootmine saavutas 2008. aasta septembris 200 miljoni sõiduki piiri. Honda jõudis selle teetähiseni oma tegevuse 60. aastal, olles alustanud 1949. aastal, kui algas Dream D-tüüpi mootorrataste tootmine.